Python作為一個設(shè)計優(yōu)秀的程序語言,現(xiàn)在已廣泛應(yīng)用于各種領(lǐng)域,依靠其強大的第三方類庫,Python在各個領(lǐng)域都能發(fā)揮巨大的作用。
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下面我們就來看一下python中常用到的庫:
數(shù)值計算庫:
1. NumPy
支持多維數(shù)組與矩陣運算,也針對數(shù)組運算提供大量的數(shù)學(xué)函數(shù)庫。通常與SciPy和Matplotlib一起使用,支持比Python更多種類的數(shù)值類型,其中定義的最重要的對象是稱為ndarray的n維數(shù)組類型,用于描述相同類型的元素集合,可以使用基于0的索引訪問集合中元素。
2. SciPy
在NumPy庫的基礎(chǔ)上增加了眾多的數(shù)學(xué)、科學(xué)及工程計算中常用的庫函數(shù),如線性代數(shù)、常微分方程數(shù)值求解、信號處理、圖像處理、稀疏矩陣等,可進行插值處理、信號濾波,以及使用C語言加速計算。
3. Pandas
基于NumPy的一種工具,為解決數(shù)據(jù)分析任務(wù)而生。納入大量庫和一些標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)模型,提供高效地操作大型數(shù)據(jù)集所需的工具及大量的能快速便捷處理數(shù)據(jù)的函數(shù)和方法,為時間序列分析提供很好的支持,提供多種數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu),如Series、Time-Series、DataFrame和Panel。
數(shù)據(jù)可視化庫:
4. Matplotlib
第一個Python可視化庫,有許多別的程序庫都是建立在其基礎(chǔ)上或者直接調(diào)用該庫,可以很方便地得到數(shù)據(jù)的大致信息,功能非常強大,但也非常復(fù)雜。
5. Seaborn
利用了Matplotlib,用簡潔的代碼來制作好看的圖表。與Matplotlib最大的區(qū)別為默認(rèn)繪圖風(fēng)格和色彩搭配都具有現(xiàn)代美感。
6. ggplot
基于R的一個作圖庫ggplot2,同時利用了源于《圖像語法》(The Grammar of Graphics)中的概念,允許疊加不同的圖層來完成一幅圖,并不適用于制作非常個性化的圖像,為操作的簡潔度而犧牲了圖像的復(fù)雜度。
7. Bokeh
跟ggplot一樣,Bokeh也基于《圖形語法》的概念。與ggplot不同之處為它完全基于Python而不是從R處引用。長處在于能用于制作可交互、可直接用于網(wǎng)絡(luò)的圖表。圖表可以輸出為JSON對象、HTML文檔或者可交互的網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用。
8. Plotly
可以通過Python notebook使用,與Bokeh一樣致力于交互圖表的制作,但提供在別的庫中幾乎沒有的幾種圖表類型,如等值線圖、樹形圖和三維圖表。
9. pygal
與Bokeh和Plotly一樣,提供可直接嵌入網(wǎng)絡(luò)瀏覽器的可交互圖像。與其他兩者的主要區(qū)別在于可將圖表輸出為SVG格式,所有的圖表都被封裝成方法,且默認(rèn)的風(fēng)格也很漂亮,用幾行代碼就可以很容易地制作出漂亮的圖表。
10. geoplotlib
用于制作地圖和地理相關(guān)數(shù)據(jù)的工具箱??捎脕碇谱鞫喾N地圖,比如等值區(qū)域圖、熱度圖、點密度圖。必須安裝Pyglet(一個面向?qū)ο缶幊探涌冢┓娇墒褂谩?/p>
11. missingno
用圖像的方式快速評估數(shù)據(jù)缺失的情況,可根據(jù)數(shù)據(jù)的完整度對數(shù)據(jù)進行排序或過濾,或者根據(jù)熱度圖或樹狀圖對數(shù)據(jù)進行修正。
web開發(fā)庫:
12. Django
一個高級的Python Web框架,支持快速開發(fā),提供從模板引擎到ORM所需的一切東西,使用該庫構(gòu)建App時,必須遵循Django的方式。
13. Socket
一個套接字通訊底層庫,用于在服務(wù)器和客戶端間建立TCP或UDP連接,通過連接發(fā)送請求與響應(yīng)。
14. Flask
一個基于Werkzeug、Jinja 2的Python輕量級框架(microframework),默認(rèn)配備Jinja模板引擎,也包含其他模板引擎或ORM供選擇,適合用來編寫API服務(wù)(RESTful rervices)。
15. Twisted
一個使用Python實現(xiàn)的基于事件驅(qū)動的網(wǎng)絡(luò)引擎框架,建立在deferred object之上,一個通過異步架構(gòu)實現(xiàn)的高性能的引擎,不適用于編寫常規(guī)的Web Apps,更適用于底層網(wǎng)絡(luò)。
數(shù)據(jù)庫管理:
16. MySQL-python
又稱MySQLdb,是Python連接MySQL最流行的一個驅(qū)動,很多框架也基于此庫進行開發(fā)。只支持Python 2.x,且安裝時有許多前置條件。由于該庫基于C語言開發(fā),在Windows平臺上的安裝非常不友好,經(jīng)常出現(xiàn)失敗的情況,現(xiàn)在基本不推薦使用,取代品為衍生版本。
17. mysqlclient
完全兼容MySQLdb,同時支持Python 3.x,是Django ORM的依賴工具,可使用原生SQL來操作數(shù)據(jù)庫,安裝方式與MySQLdb一致。
18. PyMySQL
純Python實現(xiàn)的驅(qū)動,速度比MySQLdb慢,最大的特點為安裝方式簡潔,同時也兼容MySQL-python。
19. SQLAlchemy
一種既支持原生SQL,又支持ORM的工具。ORM是Python對象與數(shù)據(jù)庫關(guān)系表的一種映射關(guān)系,可有效提高寫代碼的速度,同時兼容多種數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),如SQLite、MySQL、PostgreSQL,代價為性能上的一些損失。
自動化運維:
20. jumpsever跳板機
一種由Python編寫的開源跳板機(堡壘機)系統(tǒng),實現(xiàn)了跳板機的基本功能,包含認(rèn)證、授權(quán)和審計,集成了Ansible、批量命令等。
支持WebTerminal Bootstrap編寫,界面美觀,自動收集硬件信息,支持錄像回放、命令搜索、實時監(jiān)控、批量上傳下載等功能,基于SSH協(xié)議進行管理,客戶端無須安裝agent。主要用于解決可視化安全管理,因完全開源,容易再次開發(fā)。
21. Magedu分布式監(jiān)控系統(tǒng)
一種用Python開發(fā)的自動化監(jiān)控系統(tǒng),可監(jiān)控常用系統(tǒng)服務(wù)、應(yīng)用、網(wǎng)絡(luò)設(shè)備,可在一臺主機上監(jiān)控多個不同服務(wù),不同服務(wù)的監(jiān)控間隔可以不同,同一個服務(wù)在不同主機上的監(jiān)控間隔、報警閾值可以不同,并提供數(shù)據(jù)可視化界面。
22. Magedu的CMDB
一種用Python開發(fā)的硬件管理系統(tǒng),包含采集硬件數(shù)據(jù)、API、頁面管理3部分功能,主要用于自動化管理筆記本、路由器等常見設(shè)備的日常使用。由服務(wù)器的客戶端采集硬件數(shù)據(jù),將硬件信息發(fā)送至API,API負(fù)責(zé)將獲取的數(shù)據(jù)保存至數(shù)據(jù)庫中,后臺管理程序負(fù)責(zé)對服務(wù)器信息進行配置和展示。
23. 任務(wù)調(diào)度系統(tǒng)
一種由Python開發(fā)的任務(wù)調(diào)度系統(tǒng),主要用于自動化地將一個服務(wù)進程分布到其他多個機器的多個進程中,一個服務(wù)進程可作為調(diào)度者依靠網(wǎng)絡(luò)通信完成這一工作。
24. Python運維流程系統(tǒng)
一種使用Python語言編寫的調(diào)度和監(jiān)控工作流的平臺,內(nèi)部用于創(chuàng)建、監(jiān)控和調(diào)整數(shù)據(jù)管道。允許工作流開發(fā)人員輕松創(chuàng)建、維護和周期性地調(diào)度運行工作流,包括了如數(shù)據(jù)存儲、增長分析、Email發(fā)送、A/B測試等諸多跨多部門的用例。
GUI編程:
25. Tkinter
一個Python的標(biāo)準(zhǔn)GUI庫,可以快速地創(chuàng)建GUI應(yīng)用程序,可以在大多數(shù)的UNIX平臺下使用,同樣可以應(yīng)用在Windows和Macintosh系統(tǒng)中,Tkinter 8.0的后續(xù)版本可以實現(xiàn)本地窗口風(fēng)格,并良好地運行在絕大多數(shù)平臺中。
26. wxPython
一款開源軟件跨平臺GUI庫wxWidgets的Python封裝和Python模塊,是Python語言的一套優(yōu)秀的GUI圖形庫,允許程序員很方便地創(chuàng)建完整的、功能健全的GUI用戶界面。
27. PyQt
一個創(chuàng)建GUI應(yīng)用程序的工具庫,是Python編程語言和Qt的成功融合,可以運行在所有主要操作系統(tǒng)上,包括UNIX、Windows和Mac。PyQt采用雙許可證,開發(fā)人員可以選擇GPL和商業(yè)許可,從PyQt的版本4開始,GPL許可證可用于所有支持的平臺。
28. PySide
一個跨平臺的應(yīng)用程式框架Qt的Python綁定版本,提供與PyQt類似的功能,并相容API,但與PyQt不同處為其使用LGPL授權(quán)。
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竅門一:關(guān)鍵代碼使用外部功能包
Python簡化了許多編程任務(wù),但是對于一些時間敏感的任務(wù),它的表現(xiàn)經(jīng)常不盡人意。使用C/C++或機器語言的外部功能包處理時間敏感任務(wù),可以有效提高應(yīng)用的運行效率。這些功能包往往依附于特定的平臺,因此你要根據(jù)自己所用的平臺選擇合適的功能包。簡而言之,這個竅門要你犧牲應(yīng)用的可移植性以換取只有通過對底層主機的直接編程才能獲得的運行效率。以下是一些你可以選擇用來提升效率的功能包:
Cython
Pylnlne
PyPy
Pyrex
這些功能包的用處各有不同。比如說,使用C語言的數(shù)據(jù)類型,可以使涉及內(nèi)存操作的任務(wù)更高效或者更直觀。Pyrex就能幫助Python延展出這樣的功能。Pylnline能使你在Python應(yīng)用中直接使用C代碼。內(nèi)聯(lián)代碼是獨立編譯的,但是它把所有編譯文件都保存在某處,并能充分利用C語言提供的高效率。
竅門二:在排序時使用鍵
Python含有許多古老的排序規(guī)則,這些規(guī)則在你創(chuàng)建定制的排序方法時會占用很多時間,而這些排序方法運行時也會拖延程序?qū)嶋H的運行速度。最佳的排序方法其實是盡可能多地使用鍵和內(nèi)置的sort()方法。譬如,拿下面的代碼來說:
import operator
somelist = [(1, 5,?, (6, 2, 4), (9, 7, 5)]
somelist.sort(key=operator.itemgetter(0))
somelist
#Output = [(1, 5,?, (6, 2, 4), (9, 7, 5)]
somelist.sort(key=operator.itemgetter(1))
somelist
#Output = [(6, 2, 4), (1, 5,?, (9, 7, 5)]
somelist.sort(key=operator.itemgetter(2))
somelist
#Output = [(6, 2, 4), (9, 7, 5), (1, 5,?]
在每段例子里,list都是根據(jù)你選擇的用作關(guān)鍵參數(shù)的索引進行排序的。這個方法不僅對數(shù)值類型有效,還同樣適用于字符串類型。
竅門三:針對循環(huán)的優(yōu)化
每一種編程語言都強調(diào)最優(yōu)化的循環(huán)方案。當(dāng)使用Python時,你可以借助豐富的技巧讓循環(huán)程序跑得更快。然而,開發(fā)者們經(jīng)常遺忘的一個技巧是:盡量避免在循環(huán)中訪問變量的屬性。譬如,拿下面的代碼來說:
lowerlist = ['this', 'is', 'lowercase']
upper = str.upper
upperlist = []
append = upperlist.append
for word in lowerlist:
append(upper(word))
print(upperlist)
#Output = ['THIS', 'IS', 'LOWERCASE']
每次你調(diào)用str.upper, Python都會計算這個式子的值。然而,如果你把這個求值賦值給一個變量,那么求值的結(jié)果就能提前知道,Python程序就能運行得更快。因此,關(guān)鍵就是盡可能減小Python在循環(huán)中的工作量。因為Python解釋執(zhí)行的特性,在上面的例子中會大大減慢它的速度。
(注意:優(yōu)化循環(huán)的方法還有很多,這只是其中之一。比如,很多程序員會認(rèn)為,列表推導(dǎo)式是提高循環(huán)速度的最佳方法。關(guān)鍵在于,優(yōu)化循環(huán)方案是提高應(yīng)用程序運行速度的上佳選擇。)
竅門四:使用較新的Python版本
如果你在網(wǎng)上搜索Python,你會發(fā)現(xiàn)數(shù)不盡的信息都是關(guān)于如何升級Python版本。通常,每個版本的Python都會包含優(yōu)化內(nèi)容,使其運行速度優(yōu)于之前的版本。但是,限制因素在于,你最喜歡的函數(shù)庫有沒有同步更新支持新的Python版本。與其爭論函數(shù)庫是否應(yīng)該更新,關(guān)鍵在于新的Python版本是否足夠高效來支持這一更新。
你要保證自己的代碼在新版本里還能運行。你需要使用新的函數(shù)庫才能體驗新的Python版本,然后你需要在做出關(guān)鍵性的改動時檢查自己的應(yīng)用。只有當(dāng)你完成必要的修正之后,你才能體會新版本的不同。
然而,如果你只是確保自己的應(yīng)用在新版本中可以運行,你很可能會錯過新版本提供的新特性。一旦你決定更新,請分析你的應(yīng)用在新版本下的表現(xiàn),并檢查可能出問題的部分,然后優(yōu)先針對這些部分應(yīng)用新版本的特性。只有這樣,用戶才能在更新之初就覺察到應(yīng)用性能的改觀。
竅門五:嘗試多種編碼方法
每次創(chuàng)建應(yīng)用時都使用同一種編碼方法幾乎無一例外會導(dǎo)致應(yīng)用的運行效率不盡人意??梢栽诔绦蚍治鰰r嘗試一些試驗性的辦法。譬如說,在處理字典中的數(shù)據(jù)項時,你既可以使用安全的方法,先確保數(shù)據(jù)項已經(jīng)存在再進行更新,也可以直接對數(shù)據(jù)項進行更新,把不存在的數(shù)據(jù)項作為特例分開處理。請看下面第一段代碼:
n = 16
myDict = {}
for i in range(0, n):
char = 'abcd'[i%4]
if char not in myDict:
myDict[char] = 0
myDict[char] += 1
print(myDict)
當(dāng)一開始myDict為空時,這段代碼會跑得比較快。然而,通常情況下,myDict填滿了數(shù)據(jù),至少填有大部分?jǐn)?shù)據(jù),這時換另一種方法會更有效率。
n = 16
myDict = {}
for i in range(0, n):
char = 'abcd'[i%4]
try:
myDict[char] += 1
except KeyError:
myDict[char] = 1
print(myDict)
在兩種方法中輸出結(jié)果都是一樣的。區(qū)別在于輸出是如何獲得的。跳出常規(guī)的思維模式,創(chuàng)建新的編程技巧能使你的應(yīng)用更有效率。
竅門六:交叉編譯你的應(yīng)用
開發(fā)者有時會忘記計算機其實并不理解用來創(chuàng)建現(xiàn)代應(yīng)用程序的編程語言。計算機理解的是機器語言。為了運行你的應(yīng)用,你借助一個應(yīng)用將你所編的人類可讀的代碼轉(zhuǎn)換成機器可讀的代碼。有時,你用一種諸如Python這樣的語言編寫應(yīng)用,再以C++這樣的語言運行你的應(yīng)用,這在運行的角度來說,是可行的。關(guān)鍵在于,你想你的應(yīng)用完成什么事情,而你的主機系統(tǒng)能提供什么樣的資源。
Nuitka是一款有趣的交叉編譯器,能將你的Python代碼轉(zhuǎn)化成C++代碼。這樣,你就可以在native模式下執(zhí)行自己的應(yīng)用,而無需依賴于解釋器程序。你會發(fā)現(xiàn)自己的應(yīng)用運行效率有了較大的提高,但是這會因平臺和任務(wù)的差異而有所不同。
(注意:Nuitka現(xiàn)在還處在測試階段,所以在實際應(yīng)用中請多加注意。實際上,當(dāng)下最好還是把它用于實驗。此外,關(guān)于交叉編譯是否為提高運行效率的最佳方法還存在討論的空間。開發(fā)者已經(jīng)使用交叉編譯多年,用來提高應(yīng)用的速度。記住,每一種解決辦法都有利有弊,在把它用于生產(chǎn)環(huán)境之前請仔細(xì)權(quán)衡。)
在使用交叉編譯器時,記得確保它支持你所用的Python版本。Nuitka支持Python2.6, 2.7, 3.2和3.3。為了讓解決方案生效,你需要一個Python解釋器和一個C++編譯器。Nuitka支持許多C++編譯器,其中包括Microsoft Visual Studio,MinGW 和 Clang/LLVM。
交叉編譯可能造成一些嚴(yán)重問題。比如,在使用Nuitka時,你會發(fā)現(xiàn)即便是一個小程序也會消耗巨大的驅(qū)動空間。因為Nuitka借助一系列的動態(tài)鏈接庫(DDLs)來執(zhí)行Python的功能。因此,如果你用的是一個資源很有限的系統(tǒng),這種方法或許不太可行。
最優(yōu)化
為什么要做最優(yōu)化呢?因為在生活中,人們總是希望幸福值或其它達(dá)到一個極值,比如做生意時希望成本最小,收入最大,所以在很多商業(yè)情境中,都會遇到求極值的情況。
函數(shù)求根
這里「函數(shù)的根」也稱「方程的根」,或「函數(shù)的零點」。
先把我們需要的包加載進來。import numpy as npimport scipy as spimport scipy.optimize as optimport matplotlib.pyplot as plt%matplotlib inline
函數(shù)求根和最優(yōu)化的關(guān)系?什么時候函數(shù)是最小值或最大值?
兩個問題一起回答:最優(yōu)化就是求函數(shù)的最小值或最大值,同時也是極值,在求一個函數(shù)最小值或最大值時,它所在的位置肯定是導(dǎo)數(shù)為 0 的位置,所以要求一個函數(shù)的極值,必然要先求導(dǎo),使其為 0,所以函數(shù)求根就是為了得到最大值最小值。
scipy.optimize 有什么方法可以求根?
可以用 scipy.optimize 中的 bisect 或 brentq 求根。f = lambda x: np.cos(x) - x # 定義一個匿名函數(shù)x = np.linspace(-5, 5, 1000) # 先生成 1000 個 xy = f(x) # 對應(yīng)生成 1000 個 f(x)plt.plot(x, y); # 看一下這個函數(shù)長什么樣子plt.axhline(0, color='k'); # 畫一根橫線,位置在 y=0
opt.bisect(f, -5, 5) # 求取函數(shù)的根0.7390851332155535plt.plot(x, y)plt.axhline(0, color='k')plt.scatter([_], [0], c='r', s=100); # 這里的 [_] 表示上一個 Cell 中的結(jié)果,這里是 x 軸上的位置,0 是 y 上的位置
求根有兩種方法,除了上面介紹的 bisect,還有 brentq,后者比前者快很多。%timeit opt.bisect(f, -5, 5)%timeit opt.brentq(f, -5, 5)10000 loops, best of 3: 157 s per loopThe slowest run took 11.65 times longer than the fastest. This could mean that an intermediate result is being cached.10000 loops, best of 3: 35.9 s per loop
函數(shù)求最小化
求最小值就是一個最優(yōu)化問題。求最大值時只需對函數(shù)做一個轉(zhuǎn)換,比如加一個負(fù)號,或者取倒數(shù),就可轉(zhuǎn)成求最小值問題。所以兩者是同一問題。
初始值對最優(yōu)化的影響是什么?
舉例來說,先定義個函數(shù)。f = lambda x: 1-np.sin(x)/xx = np.linspace(-20., 20., 1000)y = f(x)
當(dāng)初始值為 3 值,使用 minimize 函數(shù)找到最小值。minimize 函數(shù)是在新版的 scipy 里,取代了以前的很多最優(yōu)化函數(shù),是個通用的接口,背后是很多方法在支撐。x0 = 3xmin = opt.minimize(f, x0).x # x0 是起始點,起始點最好離真正的最小值點不要太遠(yuǎn)plt.plot(x, y)plt.scatter(x0, f(x0), marker='o', s=300); # 起始點畫出來,用圓圈表示plt.scatter(xmin, f(xmin), marker='v', s=300); # 最小值點畫出來,用三角表示plt.xlim(-20, 20);
初始值為 3 時,成功找到最小值。
現(xiàn)在來看看初始值為 10 時,找到的最小值點。x0 = 10xmin = opt.minimize(f, x0).xplt.plot(x, y)plt.scatter(x0, f(x0), marker='o', s=300)plt.scatter(xmin, f(xmin), marker='v', s=300)plt.xlim(-20, 20);
由上圖可見,當(dāng)初始值為 10 時,函數(shù)找到的是局部最小值點,可見 minimize 的默認(rèn)算法對起始點的依賴性。
那么怎么才能不管初始值在哪個位置,都能找到全局最小值點呢?
如何找到全局最優(yōu)點?
可以使用 basinhopping 函數(shù)找到全局最優(yōu)點,相關(guān)背后算法,可以看幫助文件,有提供論文的索引和出處。
我們設(shè)初始值為 10 看是否能找到全局最小值點。x0 = 10from scipy.optimize import basinhoppingxmin = basinhopping(f,x0,stepsize = 5).xplt.plot(x, y);plt.scatter(x0, f(x0), marker='o', s=300);plt.scatter(xmin, f(xmin), marker='v', s=300);plt.xlim(-20, 20);
當(dāng)起始點在比較遠(yuǎn)的位置,依然成功找到了全局最小值點。
如何求多元函數(shù)最小值?
以二元函數(shù)為例,使用 minimize 求對應(yīng)的最小值。def g(X): x,y = X return (x-1)**4 + 5 * (y-1)**2 - 2*x*yX_opt = opt.minimize(g, (8, 3)).x # (8,3) 是起始點print X_opt[ 1.88292611 1.37658521]fig, ax = plt.subplots(figsize=(6, 4)) # 定義畫布和圖形x_ = y_ = np.linspace(-1, 4, 100)X, Y = np.meshgrid(x_, y_)c = ax.contour(X, Y, g((X, Y)), 50) # 等高線圖ax.plot(X_opt[0], X_opt[1], 'r*', markersize=15) # 最小點的位置是個元組ax.set_xlabel(r"$x_1$", fontsize=18)ax.set_ylabel(r"$x_2$", fontsize=18)plt.colorbar(c, ax=ax) # colorbar 表示顏色越深,高度越高fig.tight_layout()
畫3D 圖。from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3Dfrom matplotlib import cmfig = plt.figure()ax = fig.gca(projection='3d')x_ = y_ = np.linspace(-1, 4, 100)X, Y = np.meshgrid(x_, y_)surf = ax.plot_surface(X, Y, g((X,Y)), rstride=1, cstride=1, cmap=cm.coolwarm, linewidth=0, antialiased=False)cset = ax.contour(X, Y, g((X,Y)), zdir='z',offset=-5, cmap=cm.coolwarm)fig.colorbar(surf, shrink=0.5, aspect=5);
曲線擬合
曲線擬合和最優(yōu)化有什么關(guān)系?
曲線擬合的問題是,給定一組數(shù)據(jù),它可能是沿著一條線散布的,這時要找到一條最優(yōu)的曲線來擬合這些數(shù)據(jù),也就是要找到最好的線來代表這些點,這里的最優(yōu)是指這些點和線之間的距離是最小的,這就是為什么要用最優(yōu)化問題來解決曲線擬合問題。
舉例說明,給一些點,找到一條線,來擬合這些點。
先給定一些點:N = 50 # 點的個數(shù)m_true = 2 # 斜率b_true = -1 # 截距dy = 2.0 # 誤差np.random.seed(0)xdata = 10 * np.random.random(N) # 50 個 x,服從均勻分布ydata = np.random.normal(b_true + m_true * xdata, dy) # dy 是標(biāo)準(zhǔn)差plt.errorbar(xdata, ydata, dy, fmt='.k', ecolor='lightgray');
上面的點整體上呈現(xiàn)一個線性關(guān)系,要找到一條斜線來代表這些點,這就是經(jīng)典的一元線性回歸。目標(biāo)就是找到最好的線,使點和線的距離最短。要優(yōu)化的函數(shù)是點和線之間的距離,使其最小。點是確定的,而線是可變的,線是由參數(shù)值,斜率和截距決定的,這里就是要通過優(yōu)化距離找到最優(yōu)的斜率和截距。
點和線的距離定義如下:def chi2(theta, x, y): return np.sum(((y - theta[0] - theta[1] * x)) ** 2)
上式就是誤差平方和。
誤差平方和是什么?有什么作用?
誤差平方和公式為:
誤差平方和大,表示真實的點和預(yù)測的線之間距離太遠(yuǎn),說明擬合得不好,最好的線,應(yīng)該是使誤差平方和最小,即最優(yōu)的擬合線,這里是條直線。
誤差平方和就是要最小化的目標(biāo)函數(shù)。
找到最優(yōu)的函數(shù),即斜率和截距。theta_guess = [0, 1] # 初始值theta_best = opt.minimize(chi2, theta_guess, args=(xdata, ydata)).xprint(theta_best)[-1.01442005 1.93854656]
上面兩個輸出即是預(yù)測的直線斜率和截距,我們是根據(jù)點來反推直線的斜率和截距,那么真實的斜率和截距是多少呢?-1 和 2,很接近了,差的一點是因為有噪音的引入。xfit = np.linspace(0, 10)yfit = theta_best[0] + theta_best[1] * xfitplt.errorbar(xdata, ydata, dy, fmt='.k', ecolor='lightgray');plt.plot(xfit, yfit, '-k');
最小二乘(Least Square)是什么?
上面用的是 minimize 方法,這個問題的目標(biāo)函數(shù)是誤差平方和,這就又有一個特定的解法,即最小二乘。
最小二乘的思想就是要使得觀測點和估計點的距離的平方和達(dá)到最小,這里的“二乘”指的是用平方來度量觀測點與估計點的遠(yuǎn)近(在古漢語中“平方”稱為“二乘”),“最小”指的是參數(shù)的估計值要保證各個觀測點與估計點的距離的平方和達(dá)到最小。
關(guān)于最小二乘估計的計算,涉及更多的數(shù)學(xué)知識,這里不想詳述,其一般的過程是用目標(biāo)函數(shù)對各參數(shù)求偏導(dǎo)數(shù),并令其等于 0,得到一個線性方程組。具體推導(dǎo)過程可參考斯坦福機器學(xué)習(xí)講義 第 7 頁。def deviations(theta, x, y): return (y - theta[0] - theta[1] * x)theta_best, ier = opt.leastsq(deviations, theta_guess, args=(xdata, ydata))print(theta_best)[-1.01442016 1.93854659]
最小二乘 leastsq 的結(jié)果跟 minimize 結(jié)果一樣。注意 leastsq 的第一個參數(shù)不再是誤差平方和 chi2,而是誤差本身 deviations,即沒有平方,也沒有和。yfit = theta_best[0] + theta_best[1] * xfitplt.errorbar(xdata, ydata, dy, fmt='.k', ecolor='lightgray');plt.plot(xfit, yfit, '-k');
非線性最小二乘
上面是給一些點,擬合一條直線,擬合一條曲線也是一樣的。def f(x, beta0, beta1, beta2): # 首先定義一個非線性函數(shù),有 3 個參數(shù) return beta0 + beta1 * np.exp(-beta2 * x**2)beta = (0.25, 0.75, 0.5) # 先猜 3 個 betaxdata = np.linspace(0, 5, 50)y = f(xdata, *beta)ydata = y + 0.05 * np.random.randn(len(xdata)) # 給 y 加噪音def g(beta): return ydata - f(xdata, *beta) # 真實 y 和 預(yù)測值的差,求最優(yōu)曲線時要用到beta_start = (1, 1, 1)beta_opt, beta_cov = opt.leastsq(g, beta_start)print beta_opt # 求到的 3 個最優(yōu)的 beta 值[ 0.25525709 0.74270226 0.54966466]
拿估計的 beta_opt 值跟真實的 beta = (0.25, 0.75, 0.5) 值比較,差不多。fig, ax = plt.subplots()ax.scatter(xdata, ydata) # 畫點ax.plot(xdata, y, 'r', lw=2) # 真實值的線ax.plot(xdata, f(xdata, *beta_opt), 'b', lw=2) # 擬合的線ax.set_xlim(0, 5)ax.set_xlabel(r"$x$", fontsize=18)ax.set_ylabel(r"$f(x, \beta)$", fontsize=18)fig.tight_layout()
除了使用最小二乘,還可以使用曲線擬合的方法,得到的結(jié)果是一樣的。beta_opt, beta_cov = opt.curve_fit(f, xdata, ydata)print beta_opt[ 0.25525709 0.74270226 0.54966466]
有約束的最小化
有約束的最小化是指,要求函數(shù)最小化之外,還要滿足約束條件,舉例說明。
邊界約束def f(X): x, y = X return (x-1)**2 + (y-1)**2 # 這是一個碗狀的函數(shù)x_opt = opt.minimize(f, (0, 0), method='BFGS').x # 無約束最優(yōu)化
假設(shè)有約束條件,x 和 y 要在一定的范圍內(nèi),如 x 在 2 到 3 之間,y 在 0 和 2 之間。bnd_x1, bnd_x2 = (2, 3), (0, 2) # 對自變量的約束x_cons_opt = opt.minimize(f, np.array([0, 0]), method='L-BFGS-B', bounds=[bnd_x1, bnd_x2]).x # bounds 矩形約束fig, ax = plt.subplots(figsize=(6, 4))x_ = y_ = np.linspace(-1, 3, 100)X, Y = np.meshgrid(x_, y_)c = ax.contour(X, Y, f((X,Y)), 50)ax.plot(x_opt[0], x_opt[1], 'b*', markersize=15) # 沒有約束下的最小值,藍(lán)色五角星ax.plot(x_cons_opt[0], x_cons_opt[1], 'r*', markersize=15) # 有約束下的最小值,紅色星星bound_rect = plt.Rectangle((bnd_x1[0], bnd_x2[0]), bnd_x1[1] - bnd_x1[0], bnd_x2[1] - bnd_x2[0], facecolor="grey")ax.add_patch(bound_rect)ax.set_xlabel(r"$x_1$", fontsize=18)ax.set_ylabel(r"$x_2$", fontsize=18)plt.colorbar(c, ax=ax)fig.tight_layout()
不等式約束
介紹下相關(guān)理論,先來看下存在等式約束的極值問題求法,比如下面的優(yōu)化問題。
目標(biāo)函數(shù)是 f(w),下面是等式約束,通常解法是引入拉格朗日算子,這里使用 ββ 來表示算子,得到拉格朗日公式為
l 是等式約束的個數(shù)。
然后分別對 w 和ββ 求偏導(dǎo),使得偏導(dǎo)數(shù)等于 0,然后解出 w 和βiβi,至于為什么引入拉格朗日算子可以求出極值,原因是 f(w) 的 dw 變化方向受其他不等式的約束,dw的變化方向與f(w)的梯度垂直時才能獲得極值,而且在極值處,f(w) 的梯度與其他等式梯度的線性組合平行,因此他們之間存在線性關(guān)系。(參考《最優(yōu)化與KKT條件》)
對于不等式約束的極值問題
常常利用拉格朗日對偶性將原始問題轉(zhuǎn)換為對偶問題,通過解對偶問題而得到原始問題的解。該方法應(yīng)用在許多統(tǒng)計學(xué)習(xí)方法中。有興趣的可以參閱相關(guān)資料,這里不再贅述。def f(X): return (X[0] - 1)**2 + (X[1] - 1)**2def g(X): return X[1] - 1.75 - (X[0] - 0.75)**4x_opt = opt.minimize(f, (0, 0), method='BFGS').xconstraints = [dict(type='ineq', fun=g)] # 約束采用字典定義,約束方式為不等式約束,邊界用 g 表示x_cons_opt = opt.minimize(f, (0, 0), method='SLSQP', constraints=constraints).xfig, ax = plt.subplots(figsize=(6, 4))x_ = y_ = np.linspace(-1, 3, 100)X, Y = np.meshgrid(x_, y_)c = ax.contour(X, Y, f((X, Y)), 50)ax.plot(x_opt[0], x_opt[1], 'b*', markersize=15) # 藍(lán)色星星,沒有約束下的最小值ax.plot(x_, 1.75 + (x_-0.75)**4, '', markersize=15)ax.fill_between(x_, 1.75 + (x_-0.75)**4, 3, color="grey")ax.plot(x_cons_opt[0], x_cons_opt[1], 'r*', markersize=15) # 在區(qū)域約束下的最小值ax.set_ylim(-1, 3)ax.set_xlabel(r"$x_0$", fontsize=18)ax.set_ylabel(r"$x_1$", fontsize=18)plt.colorbar(c, ax=ax)fig.tight_layout()
scipy.optimize.minimize 中包括了多種最優(yōu)化算法,每種算法使用范圍不同,詳細(xì)參考官方文檔。
第一、NumPy
NumPy是Numerical
Python的簡寫,是Python數(shù)值計算的基石。它提供多種數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、算法以及大部分涉及Python數(shù)值計算所需的接口。NumPy還包括其他內(nèi)容:
①快速、高效的多維數(shù)組對象ndarray
②基于元素的數(shù)組計算或數(shù)組間數(shù)學(xué)操作函數(shù)
③用于讀寫硬盤中基于數(shù)組的數(shù)據(jù)集的工具
④線性代數(shù)操作、傅里葉變換以及隨機數(shù)生成
除了NumPy賦予Python的快速數(shù)組處理能力之外,NumPy的另一個主要用途是在算法和庫之間作為數(shù)據(jù)傳遞的數(shù)據(jù)容器。對于數(shù)值數(shù)據(jù),NumPy數(shù)組能夠比Python內(nèi)建數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)更為高效地存儲和操作數(shù)據(jù)。
第二、pandas
pandas提供了高級數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和函數(shù),這些數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)和函數(shù)的設(shè)計使得利用結(jié)構(gòu)化、表格化數(shù)據(jù)的工作快速、簡單、有表現(xiàn)力。它出現(xiàn)于2010年,幫助Python成為強大、高效的數(shù)據(jù)分析環(huán)境。常用的pandas對象是DataFrame,它是用于實現(xiàn)表格化、面向列、使用行列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu);以及Series,一種一維標(biāo)簽數(shù)組對象。
pandas將表格和關(guān)系型數(shù)據(jù)庫的靈活數(shù)據(jù)操作能力與Numpy的高性能數(shù)組計算的理念相結(jié)合。它提供復(fù)雜的索引函數(shù),使得數(shù)據(jù)的重組、切塊、切片、聚合、子集選擇更為簡單。由于數(shù)據(jù)操作、預(yù)處理、清洗在數(shù)據(jù)分析中是重要的技能,pandas將是重要主題。
第三、matplotlib
matplotlib是最流行的用于制圖及其他二維數(shù)據(jù)可視化的Python庫,它由John D.
Hunter創(chuàng)建,目前由一個大型開發(fā)者團隊維護。matplotlib被設(shè)計為適合出版的制圖工具。
對于Python編程者來說也有其他可視化庫,但matplotlib依然使用最為廣泛,并且與生態(tài)系統(tǒng)的其他庫良好整合。
第四、IPython
IPython項目開始于2001年,由Fernando
Pérez發(fā)起,旨在開發(fā)一個更具交互性的Python解釋器。在過去的16年中,它成為Python數(shù)據(jù)技術(shù)棧中最重要的工具之一。
盡管它本身并不提供任何計算或數(shù)據(jù)分析工具,它的設(shè)計側(cè)重于在交互計算和軟件開發(fā)兩方面將生產(chǎn)力最大化。它使用了一種執(zhí)行-探索工作流來替代其他語言中典型的編輯-編譯-運行工作流。它還提供了針對操作系統(tǒng)命令行和文件系統(tǒng)的易用接口。由于數(shù)據(jù)分析編碼工作包含大量的探索、試驗、試錯和遍歷,IPython可以使你更快速地完成工作。
第五、SciPy
SciPy是科學(xué)計算領(lǐng)域針對不同標(biāo)準(zhǔn)問題域的包集合。以下是SciPy中包含的一些包:
①scipy.integrate數(shù)值積分例程和微分方程求解器
②scipy.linalg線性代數(shù)例程和基于numpy.linalg的矩陣分解
③scipy.optimize函數(shù)優(yōu)化器和求根算法
④scipy.signal信號處理工具
⑤scipy.sparse稀疏矩陣與稀疏線性系統(tǒng)求解器
SciPy與Numpy一起為很多傳統(tǒng)科學(xué)計算應(yīng)用提供了一個合理、完整、成熟的計算基礎(chǔ)。
第六、scikit-learn
scikit-learn項目誕生于2010年,目前已成為Python編程者首選的機器學(xué)習(xí)工具包。僅僅七年,scikit-learn就擁有了全世界1500位代碼貢獻(xiàn)者。其中包含以下子模塊:
①分類:SVM、最近鄰、隨機森林、邏輯回歸等
②回歸:Lasso、嶺回歸等
③聚類:K-means、譜聚類等
④降維:PCA、特征選擇、矩陣分解等
⑤模型選擇:網(wǎng)格搜索、交叉驗證、指標(biāo)矩陣
⑥預(yù)處理:特征提取、正態(tài)化
scikit-learn與pandas、statsmodels、IPython一起使Python成為高效的數(shù)據(jù)科學(xué)編程語言。
1. Pandas.apply() – 特征工程瑰寶
Pandas 庫已經(jīng)非常優(yōu)化了,但是大部分人都沒有發(fā)揮它的最大作用。想想它一般會用于數(shù)據(jù)科學(xué)項目中的哪些地方。一般首先能想到的就是特征工程,即用已有特征創(chuàng)造新特征。其中最高效的方法之一就是Pandas.apply(),即Pandas中的apply函數(shù)。
在Pandas.apply()中,可以傳遞用戶定義功能并將其應(yīng)用到Pandas Series的所有數(shù)據(jù)點中。這個函數(shù)是Pandas庫最好的擴展功能之一,它能根據(jù)所需條件分隔數(shù)據(jù)。之后便能將其有效應(yīng)用到數(shù)據(jù)處理任務(wù)中。
2. Pandas.DataFrame.loc – Python數(shù)據(jù)操作絕妙技巧
所有和數(shù)據(jù)處理打交道的數(shù)據(jù)科學(xué)家(差不多所有人了!)都應(yīng)該學(xué)會這個方法。
很多時候,數(shù)據(jù)科學(xué)家需要根據(jù)一些條件更新數(shù)據(jù)集中某列的某些值。Pandas.DataFrame.loc就是此類問題最優(yōu)的解決方法。
3. Python函數(shù)向量化
另一種解決緩慢循環(huán)的方法就是將函數(shù)向量化。這意味著新建函數(shù)會應(yīng)用于輸入列表,并返回結(jié)果數(shù)組。在Python中使用向量化能至少迭代兩次,從而加速計算。
事實上,這樣不僅能加速代碼運算,還能讓代碼更加簡潔清晰。
4. Python多重處理
多重處理能使系統(tǒng)同時支持一個以上的處理器。
此處將數(shù)據(jù)處理分成多個任務(wù),讓它們各自獨立運行。處理龐大的數(shù)據(jù)集時,即使是apply函數(shù)也顯得有些遲緩。
關(guān)于優(yōu)化Python編程的4個妙招,青藤小編就和您分享到這里了。如果您對python編程有濃厚的興趣,希望這篇文章可以為您提供幫助。如果您還想了解更多關(guān)于python編程的技巧及素材等內(nèi)容,可以點擊本站的其他文章進行學(xué)習(xí)。
網(wǎng)站題目:python優(yōu)化函數(shù)庫 Python優(yōu)化
URL鏈接:http://m.newbst.com/article14/hjhcde.html
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