小編給大家分享一下python如何處理DICOM并計(jì)算三維模型體積，相信大部分人都還不怎么了解，因此分享這篇文章給大家參考一下，希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲，下面讓我們一起去了解一下吧！

創(chuàng)新互聯(lián)公司-專業(yè)網(wǎng)站定制、快速模板網(wǎng)站建設(shè)、高性價(jià)比東港網(wǎng)站開(kāi)發(fā)、企業(yè)建站全套包干低至880元,成熟完善的模板庫(kù),直接使用。一站式東港網(wǎng)站制作公司更省心,省錢,快速模板網(wǎng)站建設(shè)找我們，業(yè)務(wù)覆蓋東港地區(qū)。費(fèi)用合理售后完善，十余年實(shí)體公司更值得信賴。

在已知DICOM和三維模型對(duì)應(yīng)掩膜的情況下，計(jì)算三維模型的體積。

思路：

1、計(jì)算每個(gè)體素的體積。每個(gè)體素為長(zhǎng)方體，x，y為PixelSpacing，z為層間距

使用pydicom.read_file讀取DICOM文件，dcm_tag.PixelSpacing獲取像素間距，dcm_tag.SliceLocation 獲取層間距

2、計(jì)算體素的個(gè)數(shù)

代碼如下：

from PIL import Image
import numpy as np
import pydicom
import os
 
def get_pixels_No(bmp_data_dir):
  pixels_No = 0
  bmp_files = os.listdir(bmp_data_dir)
  for bmp in bmp_files:
    bmp_file = os.path.join(bmp_data_dir,bmp)
    img = Image.open(bmp_file)
    img_array = np.array(img)
    # img_array.dtype為布爾類型，需要轉(zhuǎn)換為Int類型，其累加和恰好為體素總和
    img_array_int = img_array.astype(int)
    pixels_No = pixels_No+img_array_int.sum()
  return pixels_No
 
def get_pixel_info(dcm_data_dir):
 
  pixel_infos = []
  dcm_files = os.listdir(dcm_data_dir)
 
  dcm_file_1 = os.path.join(dcm_data_dir,dcm_files[0])
  dcm_tag_1 = pydicom.read_file(dcm_file_1)
  # 獲取像素間距.
  spacex, spacey = dcm_tag_1.PixelSpacing
  # 獲取層間距
  # 有些 dcm圖像并不是按照InstanceNumber進(jìn)行排序的，不能直接用最后一張的slicelocation減去第一張，再除以張數(shù)
  SliceLocations = []
  ImagePositon_z = []
  for dcm in dcm_files:
    dcm_file = os.path.join(dcm_data_dir, dcm)
    dcm_tag = pydicom.read_file(dcm_file)
    SliceLocations.append(dcm_tag.SliceLocation)
    ImagePositon_z.append(dcm_tag.ImagePositionPatient[2])
  SliceLocations_max =max(SliceLocations)
  SliceLocations_min =min(SliceLocations)
  ImagePositon_z_max = max(ImagePositon_z)
  ImagePositon_z_min = min(ImagePositon_z)
  print(SliceLocations_max)
  print(SliceLocations_min)
  print(ImagePositon_z_max)
  print(ImagePositon_z_min)
  if SliceLocations_max - SliceLocations_min < 1e-10:
    spacez = abs(ImagePositon_z_max - ImagePositon_z_min)/(len(dcm_files)-1)
  else:
    spacez = abs(SliceLocations_max - SliceLocations_min)/(len(dcm_files)-1)
  pixel_infos = [spacex, spacey, spacez]
 
  return pixel_infos
 
def get_volume(dcm_data_dir,bmp_data_dir):
  pixel_infos = get_pixel_info(dcm_data_dir)
  pixels_No = get_pixels_No(bmp_data_dir)
  volume=pixel_infos[0]*pixel_infos[1]*pixel_infos[2]*pixels_No/1000
  return volume
 
# dcm = pydicom.read_file(r"E:\20181210090945_LENG HONGYING F-44Y\Venous\0000.dcm")
# print(dcm)
# print(dcm.ImagePositionPatient[2])
# print(dcm[0x0020, 0x0032].keyword,dcm[0x0020, 0x0032].value)
 
volume=get_volume(r"E:\20181210090945_LENG HONGYING F-44Y\Venous",r"E:\20181210090945_LENG HONGYING F-44Y\Results\LungL")
print("體積為%.1f"%volume)

以上是“python如何處理DICOM并計(jì)算三維模型體積”這篇文章的所有內(nèi)容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內(nèi)容對(duì)大家有所幫助，如果還想學(xué)習(xí)更多知識(shí)，歡迎關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)成都網(wǎng)站設(shè)計(jì)公司行業(yè)資訊頻道！

另外有需要云服務(wù)器可以了解下創(chuàng)新互聯(lián)scvps.cn，海內(nèi)外云服務(wù)器15元起步，三天無(wú)理由+7*72小時(shí)售后在線，公司持有idc許可證，提供“云服務(wù)器、裸金屬服務(wù)器、高防服務(wù)器、香港服務(wù)器、美國(guó)服務(wù)器、虛擬主機(jī)、免備案服務(wù)器”等云主機(jī)租用服務(wù)以及企業(yè)上云的綜合解決方案，具有“安全穩(wěn)定、簡(jiǎn)單易用、服務(wù)可用性高、性價(jià)比高”等特點(diǎn)與優(yōu)勢(shì)，專為企業(yè)上云打造定制，能夠滿足用戶豐富、多元化的應(yīng)用場(chǎng)景需求。

分享名稱：python如何處理DICOM并計(jì)算三維模型體積-創(chuàng)新互聯(lián)
鏈接分享：http://m.newbst.com/article8/coeiop.html

成都網(wǎng)站建設(shè)公司_創(chuàng)新互聯(lián)，為您提供電子商務(wù)、營(yíng)銷型網(wǎng)站建設(shè)、定制開(kāi)發(fā)、搜索引擎優(yōu)化、品牌網(wǎng)站設(shè)計(jì)、網(wǎng)站內(nèi)鏈

廣告

聲明：本網(wǎng)站發(fā)布的內(nèi)容（圖片、視頻和文字）以用戶投稿、用戶轉(zhuǎn)載內(nèi)容為主，如果涉及侵權(quán)請(qǐng)盡快告知，我們將會(huì)在第一時(shí)間刪除。文章觀點(diǎn)不代表本網(wǎng)站立場(chǎng)，如需處理請(qǐng)聯(lián)系客服。電話：028-86922220；郵箱：631063699@qq.com。內(nèi)容未經(jīng)允許不得轉(zhuǎn)載，或轉(zhuǎn)載時(shí)需注明來(lái)源： 創(chuàng)新互聯(lián)